Marcin Wachowicz ostatnie 3,5 roku spędził w Arce Gdynia, w barwach której w sezonie 2007/2008 został wicekrólem strzelców ówczesnej II ligi. W swojej karierze występował też w Lechu Poznań, ŁKS-ie Łódź, oraz Polonii Warszawa. W sezonie 1999/2000 będąc zawodnikiem Czarnych Koszul sięgnął po tytuł mistrza Polski.
Wachowicz do Radzionkowa przybył jako wolny zawodnik, bowiem po zakończeniu poprzedniego sezonu nie przedłużył on kontraktu z gdyńskim klubem. W ekstraklasie rozegrał 96 spotkań, strzelając 16 bramek.