Kowalski jest uznanym na Dolnym Śląsku trenerem. Pracował w większości z ważnych klubów z tego regionu, sam jako piłkarz grając również w Śląsku i Ślezy Wrocław. Samodzielnie prowadził KP Wałbrzych, Śląsk Wrocław, Polar Wrocław, Inkopax Wrocław i Miedź Legnicę. Od 2005 roku przez dwa sezony Lechię Zielona Góra. Jego ostatnim sukcesem jest wywalczenie z GKP awansu do I ligi. Po kilku kolejkach został jednak zwolniony. Oprócz Odry mógł też wybrać Śląsk Wrocław, w którym miałby objąć jedną z sekcji piłkarskich.
Poza Kowalskim o stanowisko opiekuna opolan ubiegali się też: Józef Klepak, Mirosław Hajdo i Piotr Rzepka.