Wychowanek Wawelu i rodowity krakowianin Janusz Krupiński był przez niemal całą swoją karierę związany z Wisłą. Grał w jej barwach w latach 1976-1988, a w sezonie 1977/1978 świętował z nią zdobycie tytułu mistrza Polski.
W polskiej ekstraklasie Janusz Krupiński wystąpił w 179 spotkaniach i strzelił pięć bramek. Wszystkie mecze rozegrał w barwach Wisły.