Dramaturgia kwalifikacji na torze Sepang rosła wraz z zakończenie pierwszej części sesji, gdy nad torem pojawił się deszcz. Szczęśliwie dla kierowców chwilowe opady wkrótce ustąpiły, a wysoka temperatura sprawiła, że zawodnicy swoje najlepsze czasy mogli wykręcić w samej końcówce kwalifikacji na przesychającym torze.
W połowie sesji na prowadzenie przedarł Valentino Rossi. Włoch potwierdził, że tor nadaje się do coraz szybszej jazdy uzyskując wynik blisko trzy sekundy lepszy od rywali. Dopiero ósmy był lider MŚ, Marc Marquez.
Decydująca batalia rozegrała się jednak w ostatnich sekundach, gdy każdy z kierowców postawił wszystko na jedną kartę ufając w uzyskanie najlepszego wyniku na przestrzeni jednego szybkiego okrążenia. Jako pierwszy linię mety minął Jorge Lorenzo pewnie obejmując prowadzenie.
Jego wynik poprawili Valentino Rossi i Cal Crutchlow. Gdy wydawało się, że Rossi sięgnie po swoje pierwsze pole position od trzech lat, wynik kierowcy Yamahy poprawił niesamowity Marquez. Hiszpan znów dał popis wielkich umiejętności i niezwykłego opanowania emocji. W momencie, gdy znalazł się poza czołową szóstką, był w stanie pojechać rekordowo szybkie okrążenie, które zapewniło mu czwarte z rzędu i ósme w sezonie pole position.
Po upadku w czwartej sesji treningowej z udziału w wyścigu zrezygnował Stefan Bradl. Niemiec ma załamaną kostkę w prawej nodze.
Wyniki kwalifikacji do GP Malezji:
1. Marc Marquez (Honda) 2:00.011s
2. Valentino Rossi (Yamaha) +0.325s
3. Cal Crutchlow (Tech 3 Yamaha) +0.348s
4. Jorge Lorenzo (Yamaha) +0.567s
5. Dani Pedrosa (Honda) +0.681s
6. Alvaro Bautista (Gresini Honda) +0.963s
7. Bradley Smith (Tech 3 Yamaha) +1.295s
8. Andrea Dovizioso (Ducati) +1.624s
9. Aleix Espargaro (Aspar Aprilia) +2.140s
10. Andrea Iannone (Pramac Ducati) +2.525s
11. Nicky Hayden (Ducati) +2.889s
12. Stefan Bradl (LCR Honda) +1.072s
