Michał Kwiatkowski jest wychowankiem TKK Pacific Toruń. Obecnie jest zawodnikiem Team Sky. W 2014 roku został mistrzem świata w wyścigu ze startu wspólnego. W 2013 roku wywalczył tytuł drużynowego mistrza świata razem z zespołem Etixx-Quick Step. Reprezentował Polskę na Igrzyskach Olimpijskich w Londynie w 2012 roku. 20 października 2014 roku został oznaczony Złotym Krzyżem Zasługi przez prezydenta Bronisława Komorowskiego.