Do toruńskiej Energi Natalia Waligórska dołączyła przed sezonem 2008/2009. Wtedy miała pełnić rolę podstawowej rozgrywającej, ale w końcu postawiono na tej pozycji na opcję amerykańską.
W obecnych rozgrywkach popularna "Waligóra" ponownie była zmienniczka podstawowej rozgrywającej, gdyż w CCC Polkowice udało się włodarzom "Katarzynek" sprowadzić Agatę Gajdę. Waligórska nie miała zatem dużej okazji do pokazania się na parkiecie. Na boisku spędzała bowiem około 14 minut, notując średnio 3,3 punktu, 1,9 zbiórki i 1,9 przechwytu w meczu.
Waligórska to wicemistrzyni Polski z Lotosem Gdynia. Tytuł ten wywalczyła w sezonie 2007/2008. W swojej karierze była też zawodniczką INEI AZS Poznań oraz CCC Polkowice.
