Podobnie jak w minionych rozgrywkach także i w sezonie 2008/2009 pierwsza faza zmagań będzie się toczyła systemem mecz i rewanż każdy z każdym. Zmianom uległa natomiast rywalizacja pierwszych ośmiu drużyn po rundzie zasadniczej, które zmierzą się w fazie play off.
W pierwszej rundzie play off (ćwierćfinały), podobnie jak dotychczas, rywalizacja będzie się toczyć do trzech wygranych spotkań. Nowinką na tym etapie rywalizacji jest jednak fakt, że zaliczone zostaną wyniki spotkań jakie padły w sezonie zasadniczym pomiędzy zainteresowanymi drużynami. Przykładowo: zespoły X i Y wygrały ze sobą w rundzie zasadniczej po jednym spotkaniu to ćwierćfinałowa rywalizacja rozpocznie się od stanu 1:1 i potrwa do czasu, aż któraś z ekip wygra po raz trzeci.
W sezonie 2008/2009 obowiązkowo na parkiecie przez całe spotkanie będą musiały przebywać dwie polskie koszykarki. Trenerzy każdego zespołu będą mieli także obowiązek zgłoszenia do meczu dwóch zawodniczek z rocznika 1985 i młodszych. Każda drużyna musi się składać z minimum pięciu Polek (przy zgłoszeniu do meczu drużyny dziesięcioosobowej) bądź też z minimum sześciu Polek (przy zgłoszeniu do meczu zespołu jedenasto- lub dwunastoosobowego).
W pierwszej kolejce sezonu 2008/2009 zmierzą się ze sobą:
Wisła Can-Pack Kraków - ŁKS Siemens AGD Łódź
KSSSE AZS PWSZ Gorzów Wlkp. - Lotos PKO BP Gdynia
Energa Toruń - CCC Polkowice
MUKS Poznań - Finepharm AZS Kolegium Karkonoskie Jelenia Góra
Korona Kraków - INEA AZS Poznań
UTEX ROW Rybnik - Cukierki Odra Brzeg
PTK Hartmann Pabianice - PKM Duda PWSZ Leszno
Na 27 września zaplanowano natomiast mecz o Superpuchar pomiędzy mistrzem Polski Wisłą Can Pack Kraków, a zdobywcą Pucharu Polski Lotosem PKO BP Gdynia. Spotkanie rozegrane zostanie w Toruniu.
