Daniel Pudil występuje na pozycji pomocnika. Jest zawodnikiem FC Watford. Swoją karierę zaczynał w Chmelu Blsany, skąd w 2004 roku trafił do Slovana Liberec. Następnie reprezentował takie kluby jak: Slavia Praga, Racing Genk, Granada, Cesena, Watford i Shrewsbury Town. W tym ostatnim zespole przebywał na wypożyczeniu w sezonie 2015/2016. Po jego zakończeniu wrócił do FC Watford. W barwach narodowych zadebiutował 7 lutego 2007 roku. Wartość rynkowa tego piłkarza jest szacowana na około 1,5 miliona euro.