Ermir Lenjani występuje na pozycji pomocnika. Jest wychowankiem FC Winterthur. W Szwajcarii grał również w Grasshoppers Zurych oraz St. Gallen. Na początku 2015 roku przeniósł się do Francji i podpisał umowę ze Stade Rennes. W pierwszej rundzie nie otrzymał zbyt wielu szans gry i sezon 2015/2016 spędził na wypożyczeniu do FC Nantes. Ermir Lenjani jest również reprezentantem Albanii. W barwach narodowych debiutował w listopadzie 2013 roku.