Hannes Halldorsson występuje na pozycji bramkarza. Jest zawodnikiem FK Bode/Glimt. Karierę rozpoczynał w klubach z Reykjaviku: Fram i KR. Oprócz tego grał również w duńskim SK Brann oraz Sandnes Ulf, a także holenderskim NEC Nijmegen, którego wciąż jest zawodnikiem, ponieważ w FK Bode/Glimt występuje na zasadzie wypożyczenia. Halldorsson jest również podstawowym bramkarzem reprezentacji Islandii. Debiutował w niej we wrześniu 2011 roku.