Krzysztof Mączyński występuje na pozycji pomocnika. Jest podstawowym zawodnikiem Wisły Kraków, w której wychował się piłkarsko. W eliminacjach do Euro 2016 rozegrał 8 spotkań i zdobył 1 bramkę. Bez wątpienia jest jednym z ulubionych piłkarzy trenera Adama Nawałki, który otworzył mu drogę do debiutu w reprezentacji Polski. Mączyński odwdzięczył się selekcjonerowi dobrą grą i tym samym zamknął usta wszystkim krytykom. W pierwszym zespole Wisły Kraków występuje od 2007 roku. Był dwukrotnie wypożyczany do ŁKS Łódź. W 2011 roku został zawodnikiem Górnika Zabrze. Przed rozpoczęciem sezonu 2011/2012 podpisał kontrakt z chińskim klubem Guizhou Renhe. W Chinach spędził półtora roku. W lipcu 2015 roku wrócił do Wisły Kraków. Jego pseudonim to Mąka. Szacunkowe zarobki tego piłkarza to około 100 tysięcy euro rocznie.