Milan Badelj występuje na pozycji pomocnika. Jest zawodnikiem ACF Fiorentina. Swoją karierę zaczynał w NK Zagrzeb skąd w 2007 roku trafił do Dinama Zagrzeb. Był wypożyczany do Lokomotiva Zagrzeb. W 2012 roku podpisał kontrakt z Hamburgerem SV. W 2014 roku przeniósł się do Fiorentiny. W barwach narodowych zadebiutował 23 maja 2010 roku. Wartość rynkowa tego piłkarza jest szacowana na około 8 milionów euro.