Rafa Silva występuje na pozycji pomocnika. Pierwsze piłkarskie kroki stawiał w klubie Alverca. Potem trafił do młodzieżowych drużyn Feirense. W tym klubie zadebiutował w seniorskiej piłce. Spisywał się w nim bardzo dobrze, co zaowocowało szybkim transferem do SC Braga. Z klubem tym związał się w 2013 roku i jego barwy reprezentuje do dnia dzisiejszego. Rafa Silva w reprezentacji Portugalii debiutował w marcu 2014 roku w spotkaniu z Kamerunem.