Shane Duffy występuje na pozycji obrońcy. Jest zawodnikiem Blackburn Rovers. Swoją karierę zaczynał w Evertonie. W tym klubie zadebiutował jako senior i grał przez w nim przez 5 lat, ale zagrał tylko pięć spotkań. W tym czasie był wypożyczany do Burnley, Scunthorpe United i Yeovil Town. W 2014 roku podpisał kontrakt z Blackburn Rovers. W barwach narodowych zadebiutował 7 czerwca 2014 roku. Wartość rynkowa tego piłkarza jest szacowana na około 1,5 miliona euro.