Kolejną ważną zmianą to przeniesienie się Dovizioso z satelickiego do fabrycznego zespołu Hondy. Nicky Hayden dotychczas startujący w Repsol Honda dołączy do Caseya Stonera w Ducati.
Nowy - stary zespół - Pramac Racing, dotychczas nazywany Alice Team, wystawi dwóch debiutantów - będą to Niccolo Canepa oraz Mika Kallio. Toni Elias skonfliktował się z Alice Team i w przyszłym roku będzie jeździć w San Carlo Honda Gresini jako partner Alexa de Angelisa.
Po fatalnym sezonie w barwach Ducati, do Kawasaki przeniesie się Marco Melandri, jeden z bardziej doświadczonych w MotoGP motocyklistów. Miejsce Dovizioso w Scot Racing zajmie Japończyk Yuki Takahashi.
Niektórzy motocykliści zmienili również numery startowe. Najlepszy debiutant sezonu 2008, Jorge Lorenzo, zmieni numer z #48 na #99. Dani Pedrosa w 2008 roku jeździł z nr #2 za wywalczenie tytułu wicemistrzowskiego rok wcześniej. Z tego powodu za rok zobaczymy go z #3. Casey Stoner nie pojedzie więc z nr #1 który przysługuje mistrzowi świata - zobaczymy go z nr #27.
Pełna lista startowa MotoGP na sezon 2009:
3. Dani Pedrosa SPA Repsol Honda Team
4. Andrea Dovizioso ITA Respol Honda Team
5. Colin Edwards USA Tech 3 Yamaha
7. Chris Vermeulen AUS Rizla Suzuki MotoGP
14. Randy de Puniet FRA LCR Honda MotoGP
15. Alex de Angelis RSM San Carlo Honda Gresini
21. John Hopkins USA Kawasaki Racing Team
24. Toni Elias SPA San Carlo Honda Gresini
27. Casey Stoner AUS Ducati Marlboro Team
33. Marco Melandri ITA Kawasaki Racing Team
36. Mika Kallio FIN Pramac Racing
46. Valentino Rossi ITA FIAT Yamaha Team
52. James Toseland GBR Tech 3 Yamaha
59. Sete Gibernau SPA Grupo Francisco Hernando
65. Loris Capirossi ITA Rizla Suzuki MotoGP
69. Nicky Hayden USA Ducati Marlboro Team
72. Yuki Takahashi JPN Scot Racing Team MotoGP
88. Niccolo Canepa ITA Pramac Racing
99. Jorge Lorenzo SPA FIAT Yamaha Team
