25-letni napastnik po raz pierwszy opuści Dolny Śląsk, bowiem dotąd występował tylko w dwóch regionalnych zespołach. Swoje pierwsze piłkarskie kroki stawiał w Celulozie Kostrzyn nad Odrą, gdzie spędził dwa lata. Kolejne cztery sezony seniorskiej kariery poświęcił drużynie Miedzi Legnica, z która występował jeden rok na drugoligowym froncie.
Obecnie Miedź Legnica rozgrywa swoje pojedynki na trzecioligowym froncie i na dwie kolejki przed zakończeniem sezonu legniczanie nie mają większych szans na awans do drugiej ligi. Sebastian Ziajka rozegrał w ostatnią niedzielę 25. minut podczas pojedynku Miedzi ze Skalnikiem Gracze, zdołał się nawet wpisać na listę strzelców, jednak występ Ziajki w tamtejszym spotkaniu przerwała kontuzja.