Zub prowadził Żalgiris od sierpnia 2012 roku, gdy na rzecz pracy w Wilnie zrezygnował z posady asystenta Waldemara Fornalika w reprezentacji Polski. Polak sięgnął z tą drużyną po dwa Puchary Litwy (2013, 2014) i jeden Superpuchar Litwy (2013), a przede wszystkim w sezonie 2013 poprowadził Żalgiris do pierwszego od 14 lat mistrzostwa Litwy, by sezon później powtórzyć to osiągnięcie.
W sezonie 2013/2014 wyeliminował z Ligi Europejskiej poznańskiego Lecha, a w minionym tygodniu 50-latek został wybrany Trener Roku na Litwie.
[ad=rectangle]
W sobotę wileński klub poinformował, że Zub nie zdecydował się na przedłużenie wygasającego z końcem roku kontraktu. Od lutego 2014 roku piłkarzem Żalgirisu jest Jakub Wilk, który był królem asystent A Lyga w sezonie 2014. Zapracował na to miano 13 ostatnimi podaniami.
Zub prowadził wcześniej samodzielnie mniejsze mazowieckie kluby z niższych lig (KS Piaseczno, Okęcie Warszawa, Mazowsze Grójec, KS Łomianki, Pogoń Grodzisk Mazowiecki, Świt Nowy Dwór Mazowiecki). Na szczeblu centralnym jako samodzielny szkoleniowiec pracował tylko na zapleczu ekstraklasy w Świcie Nowy Dwór Mazowiecki (2005) i w najwyższej klasie rozgrywkowej w Widzewie Łódź (2007-2008).
Marek Zub powinien otrzymać szansę w klubie T-Mobile Ekstraklasy? 
