Armstrong jest bardzo wyczulony na oskarżenia pod swoim adresem o zażywanie niedozwolonego wspomagania farmakologicznego. Jego były kolega z drużyny Floyd Landis w drugiej połowie maja przyznał, że był świadkiem stosowania zabronionych środków przez rodaka.
W związku z podejrzeniami towarzyszącymi mu od powrotu do zawodowego sportu po pokonaniu nowotworu Armstrong ma wielu wrogów w środowisku kolarskim. W ubiegłym roku podczas konferencji prasowej zrównał z ziemią Paula Kimmage'a, irlandzkiego dziennikarza i byłego zawodowca, który nazwał siedmiokrotnego triumfatora Tour de France "rakiem kolarstwa" (patrz film).
