Po porzuceniu wyczynowego uprawiania sportu Piotr Nowak zajął się pracą trenerską. W latach 2004-2006 prowadził zespół D.C. United, sięgając z nim w pierwszym sezonie po tytuł mistrza kraju. W przeszłości znajdował się także w sztabie szkoleniowym reprezentacji USA do lat 23.
Nowak w maju 2009 roku objął ekipę Philadelphia Union. Powierzono mu wówczas również funkcję wiceprezesa wykonawczego klubu. W marcu 2010 roku wspomniana drużyna zadebiutowała pod wodzą naszego rodaka w Major League Soccer.
Nowak w ubiegłym roku dotarł z drużyną z Pensylwanii do fazy playoff. Do tej pory były futbolista TSV 1860 Monachium poprowadził filadelfijską drużynę w 75 meczach ligowych. W chwili obecnej Philadelphia Union zajmuje przedostatnie miejsce w konferencji wschodniej MLS.
W czwartek poinformowano, iż Nowak nie jest już trenerem i wiceprezesem klubu. Tymczasowym szkoleniowcem zespołu został John Hackworth.
W kadrze Philadelphia Union znajduje się dwóch zawodników, posiadających obywatelstwo naszego kraju - pomocnik Krystian Witkowski (były reprezentant Polski do lat 18) oraz bramkarz Chris Konopka.