Ekwueme zawitał do Polski w 2000 roku i najpierw reprezentował barwy Jezioraka Iława, z którego jesienią 2001 roku trafił do Polonii Warszawa, gdzie występował jego starszy o 6 lat brat Emmanuel Ekwueme, który notabene do dziś gra w Polsce nieprzerwanie - teraz jest zawodnikiem LZS-u Piotrówka.
Sezon 2002/2003 Martins Ekwueme spędził w Sigmie Ołomuniec, ale przed sezonem 2003/2004 niespodziewanie wylądował w krakowskiej Wiśle ery Henryka Kasperczaka, czyli tej najmocniejszej w czasach Tele-Foniki. Z Białą Gwiazdą zdobył dwa mistrzostwa Polski (2004 i 2005). Później wrócił do Polonii Warszawa, z której latem 2007 roku przeniósł się do Legii Warszawa.
Następnie występował w Zagłębiu Lubin, Zawiszy Bydgoszcz, a jesienią minionego roku był związany z Flotą Świnoujście, dla której rozegrał 8 spotkań. Jego bilans w polskiej ekstraklasie to 80 występów i 2 gole.
Jego nowy zespół to aktualny wicelider indyjskiej ekstraklasy. W 15 meczach zgromadził 28 punktów, czyli o dwa mniej od lidera tabeli.