Pekerman opiekuje się Los Cafeteros od stycznia 2012 roku. Poprowadził ich w eliminacjach do mundialu w Brazylii i na samym turnieju, podczas którego Kolumbijczycy - po raz pierwszy w historii - awansowali do ćwierćfinału, gdzie musieli uznać wyższość gospodarzy.
[ad=rectangle]
Na mocy nowego kontraktu 65-latek ma poprowadzić Kolumbię na Copa America 2015 i 2016 oraz w eliminacjach MŚ 2018.
Praca z reprezentacją Kolumbii nie jest pierwszą w karierze. Wcześniej w latach 2004-2006 był selekcjonerem Argentyny, a w latach 1994-2001 prowadził młodzieżową kadrę Albicelestes.