Podczas porannej sesji treningowej zawodnicy poprawili swoje czasy z piątku. Najszybszy na torze w Misano okazał się Jorge Lorenzo, który jedno okrążenie pokonał w czasie 1:32.192, ustanawiając tym samym nowy rekord toru.
Zaraz za Lorenzo sklasyfikowani zostali Marc Marquez oraz Valentino Rossi. O ile Hiszpan stracił do zwycięzcy tylko 0.229 s., o tyle strata "Doctora" wyniosła już 0.601 s.
Niespodzianką in minus jest słaba postawa reprezentantów Suzuki, którzy zajęli miejsca poza czołową dziesiątką. Aleix Espargaro zakończył rywalizację na dwunastym miejscu, a Maverick Vinales był trzynasty. W tej sytuacji obaj motocykliści będą musieli wystąpić w pierwszej części kwalifikacji, przeznaczonej dla słabszych zawodników.
Wyniki 3. treningu przed wyścigiem o Grand Prix San Marino:
| Pozycja | Zawodnik | Zespół | Czas/strata |
|---|---|---|---|
| 1 | Jorge Lorenzo | Movistar Yamaha MotoGP | 1:32.192 |
| 2 | Marc Marquez | Repsol Honda Team | +0.229 |
| 3 | Valentino Rossi | Movistar Yamaha MotoGP | +0.601 |
| 4 | Andrea Dovizioso | Ducati Team | +0.610 |
| 5 | Dani Pedrosa | Repsol Honda Team | +0.663 |
| 6 | Michele Pirro | Ducati Team | +0.738 |
| 7 | Bradley Smith | Monster Yamaha Tech3 | +0.768 |
| 8 | Andrea Iannone | Ducati Team | +0.768 |
| 9 | Pol Espargaro | Monster Yamaha Tech3 | +0.820 |
| 10 | Danilo Petrucci | Pramac Racing | +0.821 |
Czy po wyścigu o Grand Prix San Marino Jorge Lorenzo obejmie prowadzenie w mistrzostwach? 
