Marcin Juszczyk jest wychowankiem Wisły Kraków. W wieku 15 lat został on dołączony do II zespołu Białej Gwiazdy. Bramkarz zadebiutował w ekstraklasie w czerwcu 2005 roku w pojedynku przeciwko Groclinowi Grodzisk Wlkp.
Jednak nigdy nie przebił się on na stałe do podstawowego składu drużyny z Reymonta. W swojej karierze grał on też na zasadzie wypożyczenia w niższych ligach w barwach takich zespołów jak LKS Niedźwiedź oraz Górnik Wieliczka.
W zimowym okienku transferowym minionego sezonu 24-letni golkiper podpisał umowę z cypryjskim drugoligowcem, AS Néa Salamís Ammochóstos. Z drużyną tą awansował on do najwyższej klasy rozgrywkowej na Wyspie Afrodyty.
Teraz włodarze beniaminka oficjalnie ogłosili przedłużenie kontraktu z Juszczykiem na sezon 2009/2010. Jednak jednocześnie w komunikacie zaznaczono, że umowa wejdzie w życie, jeżeli Polak pomyślnie przejdzie badania medyczne, co wydaje się być formalnością.
