Thomas Mueller może grać zarówno w ataku, jak i na prawej pomocy. Jest zawodnikiem Bayernu Monachium. Pierwsze piłkarskie kroki stawiał jednak w klubie TSV Pahl. Do Monachium przeniósł się w wieku 10 lat. Do pierwszej drużyny został włączony w 2008 roku i w sierpniu zadebiutował w Bundeslidze. W kolRozwińejnym sezonie był już ważnym graczem Bayernu i regularnie pojawiał się na boisku w pierwszym składzie. W marcu 2010 roku po raz pierwszy zagrał w reprezentacji Niemiec.